醫(yī)院的成本包含固定成本和變動(dòng)成本，固定成本不以業(yè)務(wù)量的變化而變化，它是由房屋折舊、設(shè)備折舊、人員固定工資為主要項(xiàng)目組成的，變動(dòng)成本由醫(yī)用耗材，水電開支等等構(gòu)成，隨業(yè)務(wù)量的變化而變化。在“全成本核算”中，固定成本是科室無法控制的，完全按照財(cái)務(wù)核算的原則分?jǐn)偨o科室，不管科室收入多少都要扣除，這就會(huì)出現(xiàn)科室收入少于成本時(shí)，也就是沒有收支結(jié)余時(shí)，科室就沒有績效工資。

另一方面，全成本核算時(shí)還會(huì)出現(xiàn)兩種情況，一是當(dāng)科室開展新技術(shù)、新業(yè)務(wù)初期，投入的設(shè)備折舊會(huì)加大科室成本比例，降低收支結(jié)余比例，意味著績效工資會(huì)減少，二是醫(yī)院的成本價(jià)格是由市場調(diào)控的，而醫(yī)院的收費(fèi)則是由政府調(diào)控，非常滯后，就會(huì)出現(xiàn)科室收入增長幅度慢與成本增長幅度，同時(shí)意味著收支結(jié)余比例下降，績效工資增長緩慢或者不增長，這兩種情況都會(huì)影響員工的積極性。

全成本核算公式為全收入減去全支出，在科室成本支出里，變動(dòng)成本在總成本中占的比重很輕，科室人員努力節(jié)約變動(dòng)成本，對(duì)績效而言造成的差異不大，大家會(huì)有動(dòng)力去節(jié)約成本嗎？所以說用科室全成本核算的方法計(jì)算績效工資至少有以下弊端：

1．不能真正控制需要控制的成本。

2．對(duì)以社會(huì)效益為主的科室員工不公平。

3．把快速增長的醫(yī)院成本轉(zhuǎn)嫁給員工。

4 . 不利于鼓勵(lì)科室開展新技術(shù)、新項(xiàng)目。